Prozesse finden ist u.a. mittels EnumProcesses möglich. Über die pid oder das Handle zum Prozess zu minimieren geht soweit ich weiß nicht, da ein Prozess erstmal nichts mit einem Fenster zu tun, schließlich hat ja auch nicht jeder Prozess eins.
Aber wenn du die pid hast, kannst du mit EnumWindows die Fenster durchgehen und mit GetWindowThreadProcessId schauen, ob es zu dem Prozess gehört und ggf. auf normale Weise minimieren.